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如何研究土壤微生物群落 我國科研人員提出新策略

新京報訊(記者周懷宗)近日,記者從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院獲悉,一種研究土壤微生物群落的新策略被提出,這一策略由該院農(nóng)業(yè)資源與農(nóng)業(yè)區(qū)劃研究所植物營養(yǎng)團(tuán)隊提出,相關(guān)成果發(fā)表在《土壤生物學(xué)與生物化學(xué)(Soil Biology & Biochemistry)》上。

如何研究土壤微生物群落 我國科研人員提出新策略

相對定量(RMP)和絕對定量(AMP)方法對微生物群落結(jié)構(gòu)分析的差異。中國農(nóng)科院供圖

微生物群落的組成和功能在人類健康、全球元素循環(huán)、作物生長和植物抗病中發(fā)揮關(guān)鍵作用。隨著高通量測序等技術(shù)的革命性突破,極大地增加了我們對微生物多樣性、群落結(jié)構(gòu)和物種組成的認(rèn)識。

不過,研究人員介紹,測序數(shù)據(jù)僅提供微生物群落的相對豐度變化,忽略了微生物絕對數(shù)量的變化規(guī)律。針對高通量測序數(shù)據(jù)的這一缺陷,研究人員已經(jīng)開發(fā)出多種微生物絕對豐度定量方法,例如,內(nèi)參法、熒光定量法與高通量測序結(jié)合、流式細(xì)胞儀與高通量測序結(jié)合等。然而,這些定量方法的普遍適用性和精確度尚不清楚。

在此次研究中,團(tuán)隊利用采自黑龍江海倫和海南三亞的兩類差異較大的土壤樣品,評估了土壤微生物研究中最常用的兩種絕對定量方法內(nèi)參法和熒光定量法與高通量測序結(jié)合的方法。結(jié)果表明:內(nèi)參法在準(zhǔn)確性、穩(wěn)定性和工作量等方面沒有顯示出任何優(yōu)勢。相比之下,更常用的熒光定量法與高通量測序結(jié)合的方法對探究環(huán)境擾動對土壤微生物動力學(xué)的影響提供了有價值的見解??紤]其穩(wěn)定性和技術(shù)可行性,熒光定量法與高通量測序結(jié)合方法可廣泛應(yīng)用于土壤微生物群落的定量研究。

新京報記者周懷宗

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