在這樣的工作機制下，黑臭治理存在的問題一一暴露在眼前。通過對部分督查結果系統(tǒng)分析，生態(tài)環(huán)境部認為目前存在的主要問題有：

一是排查不認真不到位。黑臭水體在城市里存在，大家都是知道的，沒有上報，沒有排查清楚，反映了工作不夠認真。

二是控源截污不到位。存在非法排污口、城鎮(zhèn)污水管網(wǎng)不配套、污水處理能力不足、截留污水未經處理異地排放、雨污合流。另外還發(fā)現(xiàn)部分企業(yè)存在超排、偷排，建成區(qū)外污染沒有得到有效控制。

三是垃圾收集轉運處理處置措施未得到有效落實，一些河面有大面積漂浮物，河岸隨意堆放垃圾，垃圾滲濾液很容易隨雨水進入河道污染水體。

四是內源污染未得到有效解決。有的河道重污染底泥未得到有效清除，完成整治河道仍然有大量翻泥現(xiàn)象，極易造成二次污染。

五是部分地區(qū)治標不治本，反彈風險很高。有的地方調水沖污、應急加藥；有的地方給河流加蓋，眼不見心不煩；還有的城市把污水放到河道里，在河道下游建一個臨時性污水處理設施，一到下雨是根本擋不住污水泛濫，很容易造成水體反黑。

據(jù)悉，此次專項行動結束后，凡是黑臭現(xiàn)象反彈、群眾有意見的，經核實重新列入黑臭水體清單，將繼續(xù)督促整治。張波說，“一些地方搞治標不治本，搞形式主義，可以丟掉幻想了。問題一旦列入國家清單，我們會一盯到底，不獲全勝不收兵?！?/p>