盡管安倍晉三已經承諾一定要想盡辦法彌補對相關人員造成的損失，為此專門召開了內閣會議，修改已經定下來的預算方案。但是有報道說，無論政府如何努力，十多年過去了，很多人已經搬家，無法聯(lián)絡到，有些人或已故去，完全彌補損失是不可能的。

和找到所有受害者同樣困難的還有，要重新計算出應發(fā)保險額，必須要修改系統(tǒng)，這不僅需要花費很長時間，而且更新系統(tǒng)的費用預計將達231億日元。此外，厚生勞動省已經承認，過去15年間的很多數(shù)據(jù)并未留存，重新統(tǒng)計出這些數(shù)據(jù)也將是一個巨大工程。

“統(tǒng)計門”事件曝光后，日本內閣官房長官菅義偉11日宣布，將對全部56項基礎統(tǒng)計項目狀況展開調查。24日，總務省公布的調查結果顯示，在56項基礎統(tǒng)計項目中，有22項存在漏查、延遲發(fā)布、沒有公布等問題，占比近40%。其中21項基礎統(tǒng)計的方法涉嫌違反統(tǒng)計法。

這一結果，令社會各界對政府重要基礎統(tǒng)計“草率不扎實”的質疑得到印證。對此，總務省統(tǒng)計委員會決定設立專門機構，對基礎統(tǒng)計項目以外的233項統(tǒng)計項目的狀況也展開全面排查。

安倍在15日的政府和執(zhí)政黨聯(lián)絡會議上對國民表示了道歉。他說，發(fā)生這樣的事實在遺憾，使國民失去了對統(tǒng)計的信賴。為了不給國民帶來不利，政府一定謀求萬全的必要對策。安倍當天傍晚召見了根本匠，要求其徹查原因。

總務省認為，厚生勞動省在“每月勞動統(tǒng)計”中使用違規(guī)統(tǒng)計方法事件涉嫌違反統(tǒng)計法。根據(jù)日本統(tǒng)計法第60條，在基礎統(tǒng)計中有造假行為的人最高可判處6個月以下刑罰，并處以50萬日元以下罰款。但是據(jù)專家介紹，事實上在日本統(tǒng)計法適用門檻很高，1970年以來被追究刑事責任的僅有2例。