上合組織從安全領(lǐng)域的互信起步，倡導(dǎo)新型安全觀，以合作促安全，從一開始就徹底摒棄冷戰(zhàn)思維、強權(quán)政治；秉持開放的原則，不針對第三方，成員國結(jié)伴不結(jié)盟，不謀求建立軍事政治同盟；強調(diào)大小國家一律平等的原則，尊重差異，協(xié)商一致，互利共贏，代表了區(qū)域合作的新方向，符合冷戰(zhàn)以后地區(qū)各國求和平、謀發(fā)展的根本訴求。

　　機制建設(shè)的特色

上合組織成立后的第一個十年，是地區(qū)形勢急劇變化的時期。美國及其盟友的反恐戰(zhàn)爭、一些獨聯(lián)體國家發(fā)生的“顏色革命”、全球性的金融危機，使地區(qū)格局發(fā)生深刻調(diào)整，但上合組織經(jīng)受住了這些突發(fā)事件的考驗，內(nèi)部的凝聚力不斷增強。通過建立起多層次的例行會晤機制，成員國保持了經(jīng)常性的密切接觸，通過對話、協(xié)商不僅解決相互間的分歧，而且對地區(qū)問題、國際事務(wù)能夠形成共識、統(tǒng)一立場。

國家元首理事會是該組織的最高領(lǐng)導(dǎo)機構(gòu)，負(fù)責(zé)研究、確定多邊合作與活動的戰(zhàn)略、優(yōu)先領(lǐng)域和基本方向，通過重要文件。政府首腦（總理）會議每年召開一次，舉辦國總理擔(dān)任主席；外長會議每年在元首峰會之前的一個月舉行，地點與峰會一致；國家協(xié)調(diào)員理事會由成員國各自任命的國家協(xié)調(diào)員組成，為高級別的會議做準(zhǔn)備。2004年啟動了秘書處和地區(qū)反恐怖機構(gòu)兩個常設(shè)機構(gòu)，領(lǐng)導(dǎo)人由各成員國輪流擔(dān)任，充分體現(xiàn)了平等的原則。

為落實元首會議和總理會議的決議，推進(jìn)各領(lǐng)域合作，上合組織還陸續(xù)啟動了各部門領(lǐng)導(dǎo)人會議，在成員國輪流舉行。截至目前，上合組織框架內(nèi)已建立國防部長、經(jīng)貿(mào)部長、交通部長、文化部長、教育部長、科技部長、農(nóng)業(yè)部長、公安（內(nèi)務(wù)）部長、安全會議秘書、總檢察長以及執(zhí)法安全、緊急救災(zāi)等部門領(lǐng)導(dǎo)人的會議機制。有的會晤機制下還設(shè)有高官會或工作組、專家組，負(fù)責(zé)具體實施合作計劃或提供政策咨詢。上合組織框架內(nèi)還建立一些民間協(xié)調(diào)機制，如實業(yè)家委員會是聯(lián)系成員國實業(yè)和金融界的非政府組織；銀行聯(lián)合體由成員國賦予全權(quán)的銀行組成，旨在為經(jīng)濟項目提供資金支持。