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解鎖智慧育種,油菜中國“芯”煉成記

日前,由江西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院牽頭,聯(lián)合華中農(nóng)業(yè)大學(xué)、蘇州拉索生物芯片科技有限公司(以下簡稱“拉索生物”)正式發(fā)布我國首款甘藍(lán)型油菜20K固相基因芯片——“中芯油1號”。這枚小小的芯片,不處理數(shù)據(jù),不運(yùn)行程序,卻能“讀出”一株油菜未來的產(chǎn)量潛力、抗病能力、生長活力,不僅打破了國外近20年的基因芯片壟斷,更讓中國油菜種業(yè)從“看天吃飯”的傳統(tǒng)育種,邁入“精準(zhǔn)導(dǎo)航”的智慧育種時代。近日,《環(huán)球時報》記者專訪了相關(guān)研發(fā)人員,聽他們講述這枚“中國芯”背后的故事。

解鎖智慧育種,油菜中國“芯”煉成記

“中芯油1號”芯片(受訪者提供)

為油菜量身打造基因芯片

提到芯片,人們首先想到的是電腦、手機(jī)里的半導(dǎo)體芯片,而“中芯油1號”這枚專門為油菜“量身定制”的基因芯片,與電腦芯片有著本質(zhì)區(qū)別,卻同樣承載著核心支撐的作用?!皟烧叨际切酒仃?,但‘內(nèi)核’完全不同。”江西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院研究員陳倫林解釋道,電腦芯片集成的是晶體管,靠0和1實(shí)現(xiàn)功能?!爸行居?號”集成的是油菜基因組上的位點(diǎn)信息,相當(dāng)于為每個關(guān)鍵基因“做了專屬標(biāo)記”。

“以前只有等到油菜長出來、榨了油,才知道含油量高低,但為什么高、為什么低,背后的基因邏輯我們一無所知。”陳倫林說,“基因芯片讓我們看到了育種的底層邏輯:是哪些基因決定了性狀,從而實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)篩選、定向培育?!?/p>

作為項(xiàng)目主導(dǎo)單位,江西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院深耕油菜基因研究十余年,長期持續(xù)發(fā)掘、積累油菜核心功能基因位點(diǎn),為芯片研發(fā)筑牢了核心數(shù)據(jù)根基。

據(jù)《環(huán)球時報》記者了解,“中芯油1號”搭載著1.7萬余個全基因組背景標(biāo)記和1500余個功能位點(diǎn),幾乎涵蓋油菜育種研究的絕大多數(shù)需求,相當(dāng)于一本油菜關(guān)鍵基因信息“大辭典”。

江西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院李書宇博士介紹稱:“團(tuán)隊(duì)長期扎根油菜基因功能研究,系統(tǒng)收集了與含油量、抗病性、產(chǎn)量等重要性狀相關(guān)的基因位點(diǎn)?!?/p>

華中農(nóng)業(yè)大學(xué)國家油菜改良中心的易斌教授團(tuán)隊(duì)提供了眾多基因點(diǎn)位信息的幫助,進(jìn)一步豐富了芯片的位點(diǎn)庫。最終,團(tuán)隊(duì)將過去定位的油菜功能基因、測定的基因組序列,逐一轉(zhuǎn)化為可檢測的探針序列。“育種專家過去很難直接應(yīng)用論文里的抽象結(jié)果,有了我們的探針序列,就能通過芯片輕松篩選出高油酸、抗病性強(qiáng)的種質(zhì)資源。”易斌表示。

如果說江西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院解決了芯片“裝什么”的核心問題,那么拉索生物就攻克了“怎么造”的技術(shù)難關(guān)。

“我們的核心工作,便是始終貼合項(xiàng)目組的研發(fā)構(gòu)想,把芯片制造出來:包括先進(jìn)的點(diǎn)制工藝、配套的芯片試劑,還有高精度的檢測設(shè)備?!崩魃镅邪l(fā)核心人員李智介紹稱,“我們提供的制造技術(shù)和配套設(shè)備,是育種工作者不可或缺的核心工具。”通過聯(lián)合設(shè)計(jì)探針、不斷打磨芯片工藝,最終實(shí)現(xiàn)了芯片的國產(chǎn)化落地。

打破國外壟斷,告別“盲猜”育種

“中芯油1號”的發(fā)布緩解了我國油菜育種領(lǐng)域長期存在的“卡脖子”困境。此前近20年,固相芯片點(diǎn)制工藝被國外壟斷,我國育種工作者只能依賴進(jìn)口芯片,受制于人。

“以前進(jìn)口芯片單次檢測就要400元,成本太高?!标悅惲痔寡裕拔覀兿敫鶕?jù)國內(nèi)實(shí)際需求對進(jìn)口芯片進(jìn)行升級,根本不可能實(shí)現(xiàn),只能被國外技術(shù)‘卡脖子’?!眰鹘y(tǒng)育種模式同樣低效:靠“一把尺子一桿秤”,屬于“盲猜式”育種,只有等油菜長出性狀才能檢測,還容易受環(huán)境影響。

“以前選育一個油菜品種,要在田里摸爬滾打10年;現(xiàn)在有了‘中芯油1號’,結(jié)合‘一年五熟’快速育種技術(shù),最快3年就能培育成功。”陳倫林道出了這款國產(chǎn)基因芯片帶來的育種變革。

“過去育種主要依賴經(jīng)驗(yàn),有很大不確定性,而有了芯片,不用等作物長大就能提前判斷性狀,還能實(shí)現(xiàn)大規(guī)模檢測。”易斌說,這款芯片具備了“精準(zhǔn)識別”優(yōu)良基因的能力,相當(dāng)于為育種工作者配備了“放大鏡”。

對于育種工作者和油菜產(chǎn)業(yè)來說,“中芯油1號”的意義更為深遠(yuǎn)。

李書宇解釋道,一方面,檢測成本大幅下降,單次檢測只要幾十元,72小時快速出結(jié)果,讓精準(zhǔn)育種技術(shù)能在全行業(yè)普及。另一方面,芯片集成了含油量、抗病性、產(chǎn)量、品質(zhì)等關(guān)鍵基因信息,育種工作者可以精準(zhǔn)篩選優(yōu)良材料,培育出產(chǎn)量更高、品質(zhì)更好、抗逆性更強(qiáng)的品種。

拉索生物攻克的點(diǎn)制工藝是打破壟斷的關(guān)鍵?!拔覀兪侨虻谌?、中國第一家且唯一一家能夠?qū)崿F(xiàn)固相芯片技術(shù)的生物技術(shù)企業(yè)?!崩钪潜硎?,正是因?yàn)橥黄屏藝獾墓に嚪怄i,實(shí)現(xiàn)了芯片制造、試劑、配套設(shè)備的全鏈條國產(chǎn)化,讓芯片成本大幅下降。

未來有望服務(wù)于全球油菜育種

與國際同類產(chǎn)品相比,“中芯油1號”有著顯著優(yōu)勢:單次檢測成本僅為進(jìn)口芯片的1/8左右;搭載的基因點(diǎn)位更貼合國內(nèi)育種實(shí)際需求,檢測精準(zhǔn)度達(dá)到國際先進(jìn)水平;更具競爭力的是升級靈活性?!皣獾墓滔嘤N芯片,想要升級就要從頭合成所有探針,費(fèi)錢費(fèi)時;而我們的微球芯片,只要設(shè)計(jì)新位點(diǎn)的探針,加入原有的微球池就能完成升級,非常靈活?!崩顣罱榻B稱。

“目前我們對產(chǎn)量等相關(guān)的基因點(diǎn)位積累還不夠多,未來會循序漸進(jìn),積累更多、更準(zhǔn)確的基因信息?!标悅惲直硎荆魇∞r(nóng)業(yè)科學(xué)院將組織更多油菜科研院所推進(jìn)2.0版本芯片研發(fā),基因點(diǎn)位擴(kuò)充到6萬個,相當(dāng)于從“基因辭典”升級為“基因辭?!薄!拔覀兿M行居?號’不僅服務(wù)于我國,也能為國外育種單位提供檢測服務(wù),提升全球油菜育種效率?!?/p>

(責(zé)任編輯:zx0204)

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